1、气相色谱仪必须放在有充足光线和干燥的房间，不可在有酸碱气体、潮湿的实验室中使用，不可放置于高温炉、水槽旁。
2、供试品的折光率受温度影响较大，因此在测定时需恒定温度至少半小时。
3、上、下棱镜必须清洁，勿用粗糙的纸或酸性乙醚擦拭棱镜，气相色谱仪不能用于强酸性、强碱性、腐蚀性供试品的测定。
4、气相色谱仪滴加供试品时注意玻璃棒或滴管尖不能触及棱镜，以免产生划痕。加入的量要适中，不得有气泡进入。
5、测定挥发性液体时，可将上、下棱镜关闭，将测定液沿棱镜进样孔滴入，随加随读数。测定固体样品或用标准玻片校正气相色谱仪时，只能将固体样品或标准玻片置于测定棱镜上，而不能关闭上、下棱镜。
6、气相色谱仪测定结束时，必须用能溶解供试品的溶剂（如水、乙醇、乙醚）将上、下棱镜擦拭干净并晾干。
