气相色谱仪的安装调试要按照一定的步骤和要求来操作，具体方法如下：
一、对气相色谱仪分析室的要求
(1)室内环境温度应在5~35度范围内，湿度小于等于85%(相对湿度)，且室内应保持空气流通。有条件的厂安装空调。
(2)分析室周围不得有强磁场，易燃及强腐蚀性气体。
(3)气相色谱仪主机使用220V(50Hz)独立、稳压电源，以免电压不稳定影响实验结果。
(4)供仪器使用的动力线路容量应在10KVA左右，而且仪器使用电源应尽可能不与大功率耗电量设备或经常大幅度变化的用电设备公用一条线。电源必须接地良好，一般在潮湿地面(或食盐溶液灌注)钉入长约0.5~1.0米的铁棒(丝)，然后将电源接地点与之相连，总之要求接地电阻小于1欧姆即可。(注：建议电源和外壳都接地，这样效果更好)。
(5)准备好能承受整套仪器，宽高适中，便于操作的工作平台。一般工厂以水泥平台较佳(高0.6~0.8米)，平台不要紧靠墙，应离墙0.5~1.0米，便于接线及检修用。
二、气源准备及净化
(1)气源准备:事先准备好需用气体的高压钢瓶(一般大中城市均可购到)，气体的钢瓶不能混用，只能装指定气体，每个钢瓶的颜色代表一种气体，不能互换。一般用氮气、氢气和空气这三种气体，每种气体准备两个钢瓶，以应急备用。有的厂使用氢气发生器和空气压缩机也可，但空压机必须无油。凡钢瓶气压下降到1~2Mpa时，应更换气瓶。一般厂家使用使用以上气体纯度在99.99%即可，电子捕获检测器必须使用高纯度气源99.999%以上。
(2)气源净化：为了除去各种气体中可能含有的水分、灰分和有机气体成份，在气体进入仪器之前应先经过严格净化处理。若全部使用钢瓶气体，有的色谱仪附有净化器，且内已填有5A分子筛、活性炭或硅胶，基本可满足要求。若使用一般氢气发生器，则必须加强对水分的净化处理，故应增大干燥管面积(体积在450立方厘米以上为好，填料用5A分子筛为佳)，并在发生器后接容积较大的储器桶，以减少或克服气源压力波动时对仪器基线的影响。若使用空压机作空气来源，空压机进气口应加强空气过滤，加大净化管体积，在干燥管内应填充一半5A分子筛，一半活性炭。一般国产无油气体压缩机(国产)即可满足需要。
三、气相色谱仪成套性检查及安放
气相色谱仪开箱后，按资料袋内附件清单，进行逐项清点，并将易损零件的备件予以妥善保存。然后按照仪器的使用说明书上要求，将其放置于工作平台上，并对着接线图和各插头、插座将仪器各部分按规定连接起来，连接N2000双通道色谱仪工作站。
四、气相色谱仪外气路的连接
(1)减压阀的安装：有的仪器随机带有减压阀，若没有的则要购买。所用的是2只氧气，1只氢气减压阀。将2只氧气减压阀，1只氢气减压阀分别装到氮气、空气和氢气钢瓶上(注意氢气减压阀螺纹是反向的，并在接口处加上所附的O形塑料垫圈，以便密封)，旋紧螺帽后，关闭减压阀调节手柄(即旋松)，打开钢瓶高压阀，此时减压阀高压表应有指示，关闭高压阀后，其指示压力不应下降，否则有漏，应及时排除(用垫圈或生料带密封)，有时高压阀也会漏，要注意。然后旋动调节手柄将余气排掉。
(2)外气路连接法：把钢瓶中的气体引入色谱仪中，GC-17气相色谱仪采用的是耐压聚乙烯塑料管(φ3×0.5mm)。采用聚乙烯塑料管操作简单，所以一般采用聚乙烯塑料管。在接头处就要有不锈钢衬管(φ2×20mm)和一些密封用的塑料等材料。从钢瓶到仪器的塑料管的长度视需要而定，不宜过长，然后用塑料管把气源和仪器(气体进口)连接起来。(注意：一般气相色谱仪的进气口在背面，气路接头不要接错，在仪器背面有气路接头标识）。
